SN UMLS — различия между версиями
Khludeeva (обсуждение | вклад) |
Khludeeva (обсуждение | вклад) |
||
| (не показаны 4 промежуточные версии этого же участника) | |||
| Строка 1: | Строка 1: | ||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
Семантическая сеть состоит из: | Семантическая сеть состоит из: | ||
| − | + | # Семантических типов (Semantic Types) - набора понятий, которые определяют широкие тематические категории, обеспечивающие последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS. | |
| − | + | # Семантических отношений (Semantic Relations) - набор полезных и важных отношений, которые cуществуют между семантическими типами. | |
Семантическая сеть UMLS уменьшает сложность Metathesaurus, группируя понятия в соответствии с семантическими типами, которые были им назначены. Для разработки группировок использовались следующие принципы: семантическая значимость, экономичность, полнота, исключительность, естественность и полезность. Семантическая сеть распространяется как один из источников знаний UMLS, являясь источником с открытым исходным кодом. | Семантическая сеть UMLS уменьшает сложность Metathesaurus, группируя понятия в соответствии с семантическими типами, которые были им назначены. Для разработки группировок использовались следующие принципы: семантическая значимость, экономичность, полнота, исключительность, естественность и полезность. Семантическая сеть распространяется как один из источников знаний UMLS, являясь источником с открытым исходным кодом. | ||
Цель Семантической сети - обеспечить последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS, и предоставить ряд полезных связей между этими понятиями. Вся информация о конкретных понятиях представлена в Metathesaurus UMLS. Сеть предоставляет информацию о наборе базовых семантических типов или категорий, которые могут быть привязаны к этим понятиям, и определяет набор отношений, которые могут находиться между семантическими типами. Семантическая сеть содержит 133 семантических типа и 54 отношения для обозначения биомедицинского домена. | Цель Семантической сети - обеспечить последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS, и предоставить ряд полезных связей между этими понятиями. Вся информация о конкретных понятиях представлена в Metathesaurus UMLS. Сеть предоставляет информацию о наборе базовых семантических типов или категорий, которые могут быть привязаны к этим понятиям, и определяет набор отношений, которые могут находиться между семантическими типами. Семантическая сеть содержит 133 семантических типа и 54 отношения для обозначения биомедицинского домена. | ||
Семантические типы являются узлами в Семантической сети, а отношения между ними являются связями. Существуют основные группировки семантических типов для организмов, анатомических структур, биологических функций, химических веществ, событий, физических объектов, а также концепций или идей. Текущая область семантических типов UMLS достаточно абстрактна, что позволяет применять семантическую категоризацию широкого круга понятий во множестве доменов. | Семантические типы являются узлами в Семантической сети, а отношения между ними являются связями. Существуют основные группировки семантических типов для организмов, анатомических структур, биологических функций, химических веществ, событий, физических объектов, а также концепций или идей. Текущая область семантических типов UMLS достаточно абстрактна, что позволяет применять семантическую категоризацию широкого круга понятий во множестве доменов. | ||
| − | [[Файл:1.jpg]] | + | <center>[[Файл:1.jpg]]</center> |
| − | Рисунок 1. Пример иерархи для семантического типа «Биологическая функция» | + | <center>Рисунок 1. Пример иерархи для семантического типа «Биологическая функция»</center> |
На рисунке 1 показана часть семантической сети для семантического типа «Биологическая функция», который имеет двух детей: «Физиологическая функция» и «Патологическая функция», и у каждого из них, в свою очередь, есть несколько детей и внуков. Каждый дочерний элемент в иерархии связан с его родителем семантическим отношением «isa». | На рисунке 1 показана часть семантической сети для семантического типа «Биологическая функция», который имеет двух детей: «Физиологическая функция» и «Патологическая функция», и у каждого из них, в свою очередь, есть несколько детей и внуков. Каждый дочерний элемент в иерархии связан с его родителем семантическим отношением «isa». | ||
Связи между семантическими типами обеспечивают структуру сети и представляют важные отношения в биомедицинской области. Первичной (основной) связью между семантическими типами является отношение (ссылка) «isa». «isa» устанавливает иерархию типов в семантической сети и облегчает назначение наиболее специфического (конкретного) семантического типа, доступного для назначения понятиям Metathesaurus. | Связи между семантическими типами обеспечивают структуру сети и представляют важные отношения в биомедицинской области. Первичной (основной) связью между семантическими типами является отношение (ссылка) «isa». «isa» устанавливает иерархию типов в семантической сети и облегчает назначение наиболее специфического (конкретного) семантического типа, доступного для назначения понятиям Metathesaurus. | ||
Существует также пять основных категорий неиерархических отношений: | Существует также пять основных категорий неиерархических отношений: | ||
| − | + | * физически связаны с; | |
| − | + | * пространственно связаны с; | |
| − | + | * временно связаны с; | |
| − | + | * функционально связаны с; | |
| − | + | * концептуально связаны с. | |
Каждая запись семантического типа включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, указывающий его положение в иерархии «isa», определение и его непосредственный родитель и потомки. Каждая запись семантических отношений включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, определение и набор семантических типов, которые могут быть связаны этим отношением. | Каждая запись семантического типа включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, указывающий его положение в иерархии «isa», определение и его непосредственный родитель и потомки. Каждая запись семантических отношений включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, определение и набор семантических типов, которые могут быть связаны этим отношением. | ||
| − | [[Файл:2.jpg]] | + | <center>[[Файл:2.jpg]]</center> |
| − | Рисунок 2. Пример иерархии семантических отношений | + | <center>Рисунок 2. Пример иерархии семантических отношений</center> |
Рисунок 2 иллюстрирует иерархию для семантических отношений. Взаимоотношение «влияет», одно из нескольких функциональных отношений, имеет шесть дочерних отношений, включая «управляет», «лечит» и «предотвращает» | Рисунок 2 иллюстрирует иерархию для семантических отношений. Взаимоотношение «влияет», одно из нескольких функциональных отношений, имеет шесть дочерних отношений, включая «управляет», «лечит» и «предотвращает» | ||
Отношения устанавливаются между семантическими типами высокого уровня в Семантической сети, когда это возможно, и, как правило, наследуются через ссылку «isa» всеми дочерними типами. Так, например, соотношение «процесс» («process of») установлено между семантическими типами «Биологическая функция» («Biologic Function») и «Организм» («Organism»). Таким образом, он также имеет место между «Функцией органа или ткани» («Organ or Tissue Function»), которая является «физиологической функцией» («Physiologic Function»), которая, в свою очередь, является «биологической функцией» («Biologic Function») и «животным» («Animal»), который является «организмом» («Organism»). Отношения устанавливаются между семантическими типами и необязательно применяются ко всем экземплярам понятий, которые были присвоены этим семантическим типам. То есть отношение может быть или не быть между какой-либо конкретной парой понятий. | Отношения устанавливаются между семантическими типами высокого уровня в Семантической сети, когда это возможно, и, как правило, наследуются через ссылку «isa» всеми дочерними типами. Так, например, соотношение «процесс» («process of») установлено между семантическими типами «Биологическая функция» («Biologic Function») и «Организм» («Organism»). Таким образом, он также имеет место между «Функцией органа или ткани» («Organ or Tissue Function»), которая является «физиологической функцией» («Physiologic Function»), которая, в свою очередь, является «биологической функцией» («Biologic Function») и «животным» («Animal»), который является «организмом» («Organism»). Отношения устанавливаются между семантическими типами и необязательно применяются ко всем экземплярам понятий, которые были присвоены этим семантическим типам. То есть отношение может быть или не быть между какой-либо конкретной парой понятий. | ||
| − | [[Файл:3.jpg]] | + | |
| + | <center>[[Файл:3.jpg]]</center> | ||
| − | Рисунок 3. Пример иерархии семантических типов и отношений | + | <center>Рисунок 3. Пример иерархии семантических типов и отношений</center> |
На рисунке 3 показана часть семантической сети, иллюстрирующая связи, иерархические или ассоциативные, которые существуют между семантическими типами. | На рисунке 3 показана часть семантической сети, иллюстрирующая связи, иерархические или ассоциативные, которые существуют между семантическими типами. | ||
| − | + | ||
| − | + | ---- | |
| − | + | Ссылки | |
| − | + | * https://semanticnetwork.nlm.nih.gov | |
| − | + | * https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/ | |
| − | + | * https://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/umlssemn.html | |
| − | |||
Текущая версия на 14:05, 5 мая 2017
Семантическая сеть состоит из:
- Семантических типов (Semantic Types) - набора понятий, которые определяют широкие тематические категории, обеспечивающие последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS.
- Семантических отношений (Semantic Relations) - набор полезных и важных отношений, которые cуществуют между семантическими типами.
Семантическая сеть UMLS уменьшает сложность Metathesaurus, группируя понятия в соответствии с семантическими типами, которые были им назначены. Для разработки группировок использовались следующие принципы: семантическая значимость, экономичность, полнота, исключительность, естественность и полезность. Семантическая сеть распространяется как один из источников знаний UMLS, являясь источником с открытым исходным кодом.
Цель Семантической сети - обеспечить последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS, и предоставить ряд полезных связей между этими понятиями. Вся информация о конкретных понятиях представлена в Metathesaurus UMLS. Сеть предоставляет информацию о наборе базовых семантических типов или категорий, которые могут быть привязаны к этим понятиям, и определяет набор отношений, которые могут находиться между семантическими типами. Семантическая сеть содержит 133 семантических типа и 54 отношения для обозначения биомедицинского домена. Семантические типы являются узлами в Семантической сети, а отношения между ними являются связями. Существуют основные группировки семантических типов для организмов, анатомических структур, биологических функций, химических веществ, событий, физических объектов, а также концепций или идей. Текущая область семантических типов UMLS достаточно абстрактна, что позволяет применять семантическую категоризацию широкого круга понятий во множестве доменов.
На рисунке 1 показана часть семантической сети для семантического типа «Биологическая функция», который имеет двух детей: «Физиологическая функция» и «Патологическая функция», и у каждого из них, в свою очередь, есть несколько детей и внуков. Каждый дочерний элемент в иерархии связан с его родителем семантическим отношением «isa». Связи между семантическими типами обеспечивают структуру сети и представляют важные отношения в биомедицинской области. Первичной (основной) связью между семантическими типами является отношение (ссылка) «isa». «isa» устанавливает иерархию типов в семантической сети и облегчает назначение наиболее специфического (конкретного) семантического типа, доступного для назначения понятиям Metathesaurus. Существует также пять основных категорий неиерархических отношений:
- физически связаны с;
- пространственно связаны с;
- временно связаны с;
- функционально связаны с;
- концептуально связаны с.
Каждая запись семантического типа включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, указывающий его положение в иерархии «isa», определение и его непосредственный родитель и потомки. Каждая запись семантических отношений включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, определение и набор семантических типов, которые могут быть связаны этим отношением.
Рисунок 2 иллюстрирует иерархию для семантических отношений. Взаимоотношение «влияет», одно из нескольких функциональных отношений, имеет шесть дочерних отношений, включая «управляет», «лечит» и «предотвращает» Отношения устанавливаются между семантическими типами высокого уровня в Семантической сети, когда это возможно, и, как правило, наследуются через ссылку «isa» всеми дочерними типами. Так, например, соотношение «процесс» («process of») установлено между семантическими типами «Биологическая функция» («Biologic Function») и «Организм» («Organism»). Таким образом, он также имеет место между «Функцией органа или ткани» («Organ or Tissue Function»), которая является «физиологической функцией» («Physiologic Function»), которая, в свою очередь, является «биологической функцией» («Biologic Function») и «животным» («Animal»), который является «организмом» («Organism»). Отношения устанавливаются между семантическими типами и необязательно применяются ко всем экземплярам понятий, которые были присвоены этим семантическим типам. То есть отношение может быть или не быть между какой-либо конкретной парой понятий.
На рисунке 3 показана часть семантической сети, иллюстрирующая связи, иерархические или ассоциативные, которые существуют между семантическими типами.
Ссылки
