SN UMLS - История изменений

Khludeeva в 14:05, 5 мая 2017

2017-05-05T14:05:49Z

Khludeeva в 14:03, 5 мая 2017

2017-05-05T14:03:59Z

Khludeeva в 13:58, 5 мая 2017

2017-05-05T13:58:56Z

Khludeeva в 13:54, 5 мая 2017

2017-05-05T13:54:05Z

Khludeeva в 13:49, 5 мая 2017

2017-05-05T13:49:31Z

Khludeeva в 13:48, 5 мая 2017

2017-05-05T13:48:38Z

Khludeeva в 13:48, 5 мая 2017

2017-05-05T13:48:12Z

Khludeeva в 13:47, 5 мая 2017

2017-05-05T13:47:00Z

Khludeeva в 13:46, 5 мая 2017

2017-05-05T13:46:12Z

Khludeeva: Новая страница: «Источник информации: • https://semanticnetwork.nlm.nih.gov • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/ • https://www.nlm.nih.gov/pubs/fa…»

2017-05-05T13:44:46Z

Новая страница: «Источник информации: • https://semanticnetwork.nlm.nih.gov • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/ • https://www.nlm.nih.gov/pubs/fa…»

Новая страница

Источник информации:
• https://semanticnetwork.nlm.nih.gov
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/
• https://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/umlssemn.html

Семантическая сеть состоит из:
(1) семантических типов (Semantic Types) - набора понятий, которые определяют широкие тематические категории, обеспечивающие последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS.
(2) семантических отношений (Semantic Relations) - набор полезных и важных отношений, которые cуществуют между семантическими типами.
Семантическая сеть UMLS уменьшает сложность Metathesaurus, группируя понятия в соответствии с семантическими типами, которые были им назначены. Для разработки группировок использовались следующие принципы: семантическая значимость, экономичность, полнота, исключительность, естественность и полезность. Семантическая сеть распространяется как один из источников знаний UMLS, являясь источником с открытым исходным кодом.

Цель Семантической сети - обеспечить последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS, и предоставить ряд полезных связей между этими понятиями. Вся информация о конкретных понятиях представлена в Metathesaurus UMLS. Сеть предоставляет информацию о наборе базовых семантических типов или категорий, которые могут быть привязаны к этим понятиям, и определяет набор отношений, которые могут находиться между семантическими типами. Семантическая сеть содержит 133 семантических типа и 54 отношения для обозначения биомедицинского домена.
Семантические типы являются узлами в Семантической сети, а отношения между ними являются связями. Существуют основные группировки семантических типов для организмов, анатомических структур, биологических функций, химических веществ, событий, физических объектов, а также концепций или идей. Текущая область семантических типов UMLS достаточно абстрактна, что позволяет применять семантическую категоризацию широкого круга понятий во множестве доменов.
[[Файл:1.jpg]]

Рисунок 1. Пример иерархи для семантического типа «Биологическая функция»
На рисунке 1 показана часть семантической сети для семантического типа «Биологическая функция», который имеет двух детей: «Физиологическая функция» и «Патологическая функция», и у каждого из них, в свою очередь, есть несколько детей и внуков. Каждый дочерний элемент в иерархии связан с его родителем семантическим отношением «isa».
Связи между семантическими типами обеспечивают структуру сети и представляют важные отношения в биомедицинской области. Первичной (основной) связью между семантическими типами является отношение (ссылка) «isa». «isa» устанавливает иерархию типов в семантической сети и облегчает назначение наиболее специфического (конкретного) семантического типа, доступного для назначения понятиям Metathesaurus.
Существует также пять основных категорий неиерархических отношений:
• Физически связаны с
• Пространственно связаны с
• Временно связаны с
• Функционально связаны с
• Концептуально связаны с
Каждая запись семантического типа включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, указывающий его положение в иерархии «isa», определение и его непосредственный родитель и потомки. Каждая запись семантических отношений включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, определение и набор семантических типов, которые могут быть связаны этим отношением.
[[Файл:2.jpg]]
Рисунок 2. Пример иерархии семантических отношений
Рисунок 2 иллюстрирует иерархию для семантических отношений. Взаимоотношение «влияет», одно из нескольких функциональных отношений, имеет шесть дочерних отношений, включая «управляет», «лечит» и «предотвращает»
Отношения устанавливаются между семантическими типами высокого уровня в Семантической сети, когда это возможно, и, как правило, наследуются через ссылку «isa» всеми дочерними типами. Так, например, соотношение «процесс» («process of») установлено между семантическими типами «Биологическая функция» («Biologic Function») и «Организм» («Organism»). Таким образом, он также имеет место между «Функцией органа или ткани» («Organ or Tissue Function»), которая является «физиологической функцией» («Physiologic Function»), которая, в свою очередь, является «биологической функцией» («Biologic Function») и «животным» («Animal»), который является «организмом» («Organism»). Отношения устанавливаются между семантическими типами и необязательно применяются ко всем экземплярам понятий, которые были присвоены этим семантическим типам. То есть отношение может быть или не быть между какой-либо конкретной парой понятий.
[[Файл:3.jpg]]

Рисунок 3. Пример иерархии семантических типов и отношений
На рисунке 3 показана часть семантической сети, иллюстрирующая связи, иерархические или ассоциативные, которые существуют между семантическими типами.

На рисунке 4 и 5 приведён пример отображения семантической сети на сайте https://uts.nlm.nih.gov//semanticnetwork.html
[[Файл:4.jpg]]

Рисунок 4. Пример отображения семантического типа на сайте UMLS
[[Файл:5.jpg]]

Рисунок 4. Пример отображения семантического отношения на сайте UMLS

← Предыдущая		Версия 14:05, 5 мая 2017
Строка 31:		Строка 31:

	На рисунке 3 показана часть семантической сети, иллюстрирующая связи, иерархические или ассоциативные, которые существуют между семантическими типами.		На рисунке 3 показана часть семантической сети, иллюстрирующая связи, иерархические или ассоциативные, которые существуют между семантическими типами.
−	~~На рисунке 4 и 5 приведён пример отображения семантической сети на сайте https://uts.nlm.nih.gov//semanticnetwork.html~~
−	~~<center>[[Файл:4.jpg]]</center>~~
−
−	~~<center>Рисунок 4. Пример отображения семантического типа на сайте UMLS</center>~~
−	~~<center>[[Файл:5.jpg]]</center>~~
−
−	~~<center>Рисунок 5. Пример отображения семантического отношения на сайте UMLS</center>~~

	----		----

@@ Строка 1: / Строка 1: @@
 Семантическая сеть состоит из:
 # Семантических типов (Semantic Types) - набора понятий, которые определяют широкие тематические категории, обеспечивающие последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS.
@@ Строка 43: / Строка 38: @@
 <center>Рисунок 5. Пример отображения семантического отношения на сайте UMLS</center>

← Предыдущая		Версия 13:46, 5 мая 2017
Строка 39:		Строка 39:
	[[Файл:5.jpg]]		[[Файл:5.jpg]]

−	Рисунок 4. Пример отображения семантического отношения на сайте UMLS	+	Рисунок 5. Пример отображения семантического отношения на сайте UMLS

@@ Строка 5: / Строка 5: @@
 Семантическая сеть состоит из:
-(1) семантических типов (Semantic Types) - набора понятий, которые определяют широкие тематические категории, обеспечивающие последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS.
+# Семантических типов (Semantic Types) - набора понятий, которые определяют широкие тематические категории, обеспечивающие последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS.
-(2) семантических отношений (Semantic Relations) - набор полезных и важных отношений, которые cуществуют между семантическими типами.
+# Семантических отношений (Semantic Relations) - набор полезных и важных отношений, которые cуществуют между семантическими типами.
 Семантическая сеть UMLS уменьшает сложность Metathesaurus, группируя понятия в соответствии с семантическими типами, которые были им назначены. Для разработки группировок использовались следующие принципы: семантическая значимость, экономичность, полнота, исключительность, естественность и полезность. Семантическая сеть распространяется как один из источников знаний UMLS, являясь источником с открытым исходным кодом.
 Цель Семантической сети - обеспечить последовательную категоризацию всех понятий, представленных в Metathesaurus UMLS, и предоставить ряд полезных связей между этими понятиями. Вся информация о конкретных понятиях представлена в Metathesaurus UMLS. Сеть предоставляет информацию о наборе базовых семантических типов или категорий, которые могут быть привязаны к этим понятиям, и определяет набор отношений, которые могут находиться между семантическими типами. Семантическая сеть содержит 133 семантических типа и 54 отношения для обозначения биомедицинского домена.
 Семантические типы являются узлами в Семантической сети, а отношения между ними являются связями. Существуют основные группировки семантических типов для организмов, анатомических структур, биологических функций, химических веществ, событий, физических объектов, а также концепций или идей. Текущая область семантических типов UMLS достаточно абстрактна, что позволяет применять семантическую категоризацию широкого круга понятий во множестве доменов.
-[[Файл:1.jpg]]
+<center>[[Файл:1.jpg]]</center>
-Рисунок 1. Пример иерархи для семантического типа «Биологическая функция»
+<center>Рисунок 1. Пример иерархи для семантического типа «Биологическая функция»</center>
 На рисунке 1 показана часть семантической сети для семантического типа «Биологическая функция», который имеет двух детей: «Физиологическая функция» и «Патологическая функция», и у каждого из них, в свою очередь, есть несколько детей и внуков. Каждый дочерний элемент в иерархии связан с его родителем семантическим отношением «isa».
 Связи между семантическими типами обеспечивают структуру сети и представляют важные отношения в биомедицинской области. Первичной (основной) связью между семантическими типами является отношение (ссылка) «isa». «isa» устанавливает иерархию типов в семантической сети и облегчает назначение наиболее специфического (конкретного) семантического типа, доступного для назначения понятиям Metathesaurus.
 Существует также пять основных категорий неиерархических отношений:
-* Физически связаны с
+* физически связаны с;
-* Пространственно связаны с
+* пространственно связаны с;
-* Временно связаны с
+* временно связаны с;
-* Функционально связаны с
+* функционально связаны с;
-* Концептуально связаны с
+* концептуально связаны с.
 Каждая запись семантического типа включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, указывающий его положение в иерархии «isa», определение и его непосредственный родитель и потомки. Каждая запись семантических отношений включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, определение и набор семантических типов, которые могут быть связаны этим отношением.
-[[Файл:2.jpg]]
+<center>[[Файл:2.jpg]]</center>
-Рисунок 2. Пример иерархии семантических отношений
+<center>Рисунок 2. Пример иерархии семантических отношений</center>
 Рисунок 2 иллюстрирует иерархию для семантических отношений. Взаимоотношение «влияет», одно из нескольких функциональных отношений, имеет шесть дочерних отношений, включая «управляет», «лечит» и «предотвращает»
 Отношения устанавливаются между семантическими типами высокого уровня в Семантической сети, когда это возможно, и, как правило, наследуются через ссылку «isa» всеми дочерними типами. Так, например, соотношение «процесс» («process of») установлено между семантическими типами «Биологическая функция» («Biologic Function») и «Организм» («Organism»). Таким образом, он также имеет место между «Функцией органа или ткани» («Organ or Tissue Function»), которая является «физиологической функцией» («Physiologic Function»), которая, в свою очередь, является «биологической функцией» («Biologic Function») и «животным» («Animal»), который является «организмом» («Organism»). Отношения устанавливаются между семантическими типами и необязательно применяются ко всем экземплярам понятий, которые были присвоены этим семантическим типам. То есть отношение может быть или не быть между какой-либо конкретной парой понятий.
-[[Файл:3.jpg]]
+<center>[[Файл:3.jpg]]</center>
-Рисунок 3. Пример иерархии семантических типов и отношений
+<center>Рисунок 3. Пример иерархии семантических типов и отношений</center>
 На рисунке 3 показана часть семантической сети, иллюстрирующая связи, иерархические или ассоциативные, которые существуют между семантическими типами.
 На рисунке 4 и 5 приведён пример отображения семантической сети на сайте https://uts.nlm.nih.gov//semanticnetwork.html
-[[Файл:4.jpg]]
+<center>[[Файл:4.jpg]]</center>
-Рисунок 4. Пример отображения семантического типа на сайте UMLS
+<center>Рисунок 4. Пример отображения семантического типа на сайте UMLS</center>
-[[Файл:5.jpg]]
+<center>[[Файл:5.jpg]]</center>
-Рисунок 5. Пример отображения семантического отношения на сайте UMLS
+<center>Рисунок 5. Пример отображения семантического отношения на сайте UMLS</center>

@@ Строка 1: / Строка 1: @@
 Источник информации:
-• https://semanticnetwork.nlm.nih.gov
+* https://semanticnetwork.nlm.nih.gov
-• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/
+* https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9679/
-• https://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/umlssemn.html
+* https://www.nlm.nih.gov/pubs/factsheets/umlssemn.html
 Семантическая сеть состоит из:
@@ Строка 18: / Строка 18: @@
 Связи между семантическими типами обеспечивают структуру сети и представляют важные отношения в биомедицинской области. Первичной (основной) связью между семантическими типами является отношение (ссылка) «isa». «isa» устанавливает иерархию типов в семантической сети и облегчает назначение наиболее специфического (конкретного) семантического типа, доступного для назначения понятиям Metathesaurus.
 Существует также пять основных категорий неиерархических отношений:
-• Физически связаны с
+* Физически связаны с
-• Пространственно связаны с
+* Пространственно связаны с
-• Временно связаны с
+* Временно связаны с
-• Функционально связаны с
+* Функционально связаны с
-• Концептуально связаны с
+* Концептуально связаны с
 Каждая запись семантического типа включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, указывающий его положение в иерархии «isa», определение и его непосредственный родитель и потомки. Каждая запись семантических отношений включает в себя уникальный идентификатор, номер дерева, определение и набор семантических типов, которые могут быть связаны этим отношением.
 [[Файл:2.jpg]]